بنیاد پیشبرد علم و فن آوری ایراننشاء علم2008-935X09120181222Evaluating of Iran Scientific Documents in 2018بررسی اسناد علمی ایران در سال 2018213242715FAعلی اکبرصبوریمرکز تحقیقات بیوشیمی و بیوفیزیک، دانشگاه تهران، تهران، ایران0000-0003-0604-9465Journal Article20181128Based on the number of recorded indexes in the Web of Science (WOS) in Clarivate Analytics, the number of Iranian scientific documents is 40827 (1.98% of the world value and rank of 17) in science, 2543 (0.72% of the world value and rank of 32) in social sciences, 191 (0.17% of the world value and rank of 44) in art and humanities and 41591 (1.79% of the world value and rank of 17) in total, in 2018. Increase the number of scientific documents relative to past year was 7.5%, which in comparison to the value in 2017 (8.3%) and 2016 (12.8%) shows a less acceleration. However, our contribution (1.79% of the world) has not changed relative to last year. In Emerging Sources Citation Index (ESCI), which has started as a new index in WOS since 2015, Iran had 11063 records of indexes in 2018 and by 3.4% contribution obtained the rank of ninth. Similar to the before year, USA, China and England were the ranks of one to three in the world due to their contributions of 27.37%, 18.4% and 7.0%, respectively, for scientific documents productions in 2018. University of Tehran, Tehran University of Medical Science, Shahid Beheshti University of Medical Science, Tarbiat-Modares University and Amir Kabir University of Technology, respectively, were the five top governmental universities in 2018. 15.4% of scientific documents in 2018 are related to the all branches of Islamic Azad University, which shows 1% decrease as the successively second year. By increasing the quality of Iranian scientific documents in recent years, the number of citations to Iranian articles have been increased considerably so that Impact Factor for University of Tehran has been twice during last five years.بر اساس تعداد نمایههای ثبتشده در وبگاه علم مؤسسه اطلاعات علمی تامسون رویترز در سال 2018، تعداد اسناد علمی منتشرشده ایران در علوم 40827 (98/1 درصد مقدار جهانی و رتبه هفدهم جهان)، در علوم اجتماعی 2543 (72/0 درصد مقدار جهانی و رتبه سی و دوم جهان) و در علوم انسانی و هنر 191 (17/0 درصد مقدار جهانی و رتبه چهل و چهارم جهان) و در مجموع 41591 (79/1 درصد مقدار جهانی و رتبه هفدهم جهان) میباشد. افزایش تعداد اسناد علمی ایران نسبت به سال قبل 5/7 درصد بوده است که در مقایسه با سالهای 2017 (3/8 درصد) و 2016 (8/12 درصد) از شتاب کمتری برخوردار بوده است. این در حالی است که سهم ما از تولید اسناد علمی جهان (79/1 درصد) نسبت به سال قبل، تغییری نکرده است. در نمایه استنادی نشریات نوظهور (ESCI) که از سال 2015 بهعنوان یکی از نمایههای وبگاه علم (WOS) ایجاد شده است، با ثبت 11062 و سهم 4/3 درصدی جهان، ایران در رتبه نهم تولید این اسناد قرار گرفته است. همچون سال گذشته، کشورهای امریکا، چین و انگلستان به ترتیب با 3/27، 4/18 و 0/7 درصد سهم از تولید اسناد علمی جهان در ردههای یک تا سه قرار داشتهاند. دانشگاههای تهران، علوم پزشکی تهران، علوم پزشکی شهید بهشتی، تربیت مدرس و امیرکبیر، به ترتیب، پنج دانشگاه برتر دولتی اسناد تولید علم در سال 2018 بودهاند. پانزده و چهار دهم درصد اسناد علمی تولیدی سال 2018 نیز متعلق به مجموعه دانشگاههای آزاد اسلامی بوده است که برای دومین سال پیاپی نسبت به سال گذشته یک درصد کاهش نشان میدهد. با رشد کیفیت تولیدات اسناد علمی کشور در چند سال گذشته، تعداد ارجاعات به مقالات ایران رشد چشمگیری داشته است بهطوریکه فاکتور تأثیر دانشگاه تهران در طول پنج سال گذشته دو برابر شده است.https://www.sciencecultivation.ir/article_242715_47271b1b7785b18631a432097f7bbc64.pdfبنیاد پیشبرد علم و فن آوری ایراننشاء علم2008-935X09120181222Renovate University Collaboration with Industryروزآمد نمودن همکاری دانشگاه با صنعت1420242716FAاحمدشعبانیدانشگاه شهید بهشتی،دانشکده شیمی ، شیمی آلی و نفت، تهران، ایران.Journal Article20181128The relationship and collaboration of the university and industry in the present era is rising due to the emergence and influence of modern technologies worldwide. So, the survival and development of the university and industry in national and international competitions depends on effective cooperation between them. In this article, by pointing the goals and necessity of collaboration between the university and industry, this approach of collaboration in the United States, the United Kingdom, and Japan as relatively successful patterns have been studied. The cooperation in the United States and the United Kingdom, due to large research university systems, has many similarities, but is quite different in Japan. As in Japan, collaborative policies emphasize technological targeting, the United Kingdom for research foresight plans and priority setting in science, and the United States for long-term investment in basic scientific research. In recent years, these countries have improved their methods by taking advantage of each other experiences, as Japan is focusing more on basic research, and in the United States and the United Kingdom more focused on technology-driven research. Then, the pathology of the current state of collaboration in Iran has been explained. The role of each of the three pillars of this system collaboration namely, government as the policy maker, university, and industry, has been presented in the promotion of the qualitative and quantitative partnership between the university and the industry. Finally, with the question of "What should we do?" an attempt has been made to present the role of all three key factors for the practical, continuous, and sustainable collaboration of the university and industry.ارتباط و همکاری دانشگاه و صنعت در عصر حاضر به دلیل ظهور و نفوذ فناوریهای نوین در جهان رو به افزایش است، بهطوریکه بقا و پیشرفت دانشگاه و صنعت در رقابتهای ملی و بینالمللی در گرو همکاری مؤثر میان آنها میباشد. در این مقاله با بیان اهداف و ضرورتهای همکاری دانشگاه و صنعت، شیوه این همکاری در کشورهای آمریکا، انگلستان و ژاپن الگوی نسبتاً موفقی دارند بررسی شده است. شکل همکاری در کشورهای آمریکا و انگلستان به دلیل سامانه دانشگاهی و تحقیقاتی بسیار بزرگ، شباهتهای بسیاری با هم دارند، اما در ژاپن با توجه به سامانه و سیستم دانشگاهی محدود کاملاً متفاوت میباشد. بهطوریکه در حال حاضر در ژاپن سیاستهای همکاری تأکید بر دستیابی به فناوری، در انگلستان برنامهریزی با نگاه آیندهپژوهشی و اولویت در علم و در آمریکا سرمایهگذاری درازمدت در تحقیقات پایهای و بنیادی میباشد. در سالهای اخیر این کشورها با بهرهگیری از تجربیات یکدیگر روشهای خود را بهبود بخشیدند بهطوریکه ژاپن به تحقیقات بنیادی و کشورهای آمریکا و انگلستان به تحقیقات فناوری محور بیشازپیش اولویت میدهند. سپس با بررسی و آسیبشناسی همکاری دانشگاه و صنعت در ایران، نقش برجسته هر یک از سه ارکان اصلی این همکاری یعنی، دولت بهعنوان سیاستگذار، دانشگاه و صنعت بهعنوان دو بازیگر اصلی برای بهرهمندی بیشتر جامعه از این همکاری تبیین شده است. در پایان با طرح سؤال «چه باید کرد؟» کوشش شده است راهکاری برای همکاری مؤثر، پیوسته و پایدار میان دانشگاه و صنعت ارائه شود.https://www.sciencecultivation.ir/article_242716_3c4bba9e0da58cf515b8f18413010915.pdfبنیاد پیشبرد علم و فن آوری ایراننشاء علم2008-935X09120181222Reproducibility of Scientific Dataتکرارپذیری یافته های علمی2128242717FAراحلهشاکریدانشگاه کردستان،دانشکده علوم پایه،گروه علوم زیستیJournal Article20181128Science has always tried to produce knowledge that is useful for mankind. Transparency, open access, and reproducibility are the main characteristics of science. Scientific findings are published in journal articles to promote awareness and allow other researchers to use them. Although the methods and results are explained in the articles, some presented data are not being reproducible due to various factors such as selective reporting, insufficient replication, a pressure to publish, poor mentoring and fraud. In recent years, researchers, the pharmaceutical companies and funding agencies have been concerned with this problem. These concerns have led to consider the new policies for review and publication process of papers. The practical solutions to increase reproducibility and data validation are preregistration of studies and analysis plans, creating archive databases and independent reproduction of the experiments and analysis via other scientific centers. The science should be reproducible if not that is not in the field of experimental science. The increase in reproducibility of data is required to collaboration among research institutes, researchers, funding agencies and publishers. The committee, known as TOP (Transparency and Openness Promotion), has developed the standards in order to increase the scientific data validation, if they are considered, they will greatly enhance the reproducibility.علم همیشه در تلاش بوده و خواهد بود دانشی را تولید کند که برای بشریت مفید باشد. شفافیت، دسترسی آزاد و تکرارپذیری از ویژگیهای اساسی علم است. یافتههای علمی بهصورت مقاله برای آگاهی و استفاده توسط سایر پژوهشگران جهت پیشبرد علوم، در مجلات منتشر میشود. با وجود ارائهی روشکار و نتایج در مقالهها، برخی از دادههای ارائهشده به دلیل عوامل مختلفی از جمله گزارش انتخابی، تکرار ناکافی، تحتفشار بودن برای چاپ مقاله، عدم نظارت دقیق، تقلب و جعل تکرار نمیشوند. محققان، شرکتهای دارویی و آژانسهای سرمایهگذاری نسبت به این مسئله در سالهای اخیر ابراز نگرانی کردهاند. این نگرانیها موجب شده است که سیاست های جدیدی جهت داوری و چاپ مقاله ها اتخاذ شود. پیش ثبت نام تحقیق و روشهای تحلیلی مورداستفاده، ایجاد پایگاههایی جهت آرشیو داده ها و تکرار آزمایش ها و آنالیزها بهطور مستقل توسط سایر مراکز علمی از جمله ی راهکارها جهت افزایش تکرارپذیری و اعتبار داده ها است. علم باید تکرارپذیر باشد و اگر تکرارپذیر نباشد در حوزه ی علم تجربی قرار نمیگیرد. افزایش تکرارپذیری داده ها به همکاری مراکز تحقیقاتی، پژوهشگران، آژانسهای سرمایه گذاری و ناشران نیاز دارد. کمیته هایی به نام TOP (Transparency and Openness Promotion) استانداردهایی را جهت افزایش اعتبار داده های علمی تدوین کرده است که رعایت آنها تا حد بسیار زیادی میزان تکرارپذیری را افزایش میدهد.https://www.sciencecultivation.ir/article_242717_044e56071a2cf8367ef117437392daff.pdfبنیاد پیشبرد علم و فن آوری ایراننشاء علم2008-935X09120181222Selected Items from American Association for The Advancement of Scienceبرگزیدهای از انجمن پیشرفت علم آمریکا2937242718FAمیتراپیرحقیمرکز تحقیقات بیوشیمی و بیوفیزیک، دانشگاه تهران، تهران، ایران0000-0001-6503-0815علی اکبرصبوریمرکز تحقیقات بیوشیمی و بیوفیزیک، دانشگاه تهران، تهران، ایران0000-0003-0604-9465علی اکبرموسوی موحدیمرکز تحقیقات بیوشیمی و بیوفیزیک، دانشگاه تهران، تهران، ایران0000-0002-1707-8432Journal Article20181128The American Association for the Advancement of Science (AAAS) is dedicated to "advancing science, engineering and innovation around the world for the benefit of the people." AAAS is one of the largest multicultural science associations and is the publisher of the prestigious Scientific Journal “Science”. The association will carry out its mission of advancing science and serving the community through innovations in science policy, education, professional support, public participation with science. AAAS Forum is a leading source of data and timely analysis of trends in the United States Research and Development budget. Every year, it analyzes government funding requests, monitors Congressional debates and bills on science and technology support, and monitors the long-term R & D budget to provide regular information to policymakers and the scientific community. It advocates the rights and freedoms of science and, in accordance with article 15 of the International Covenant on Economic, Social and Cultural Rights, calls on States to recognize rights in order to obtain the benefits of scientific progress and the applications of science; preserving, developing and expanding science; respecting certain freedom for scientific research; understanding the benefits of international communication and scientific cooperation.انجمن پیشرفت علم آمریکا، به دنبال پیشرفت علم، مهندسی و نوآوری در سراسر جهان برای بهرهمندی مردم تشکیل شده است. انجمن پیشرفت علم آمریکا، یکی از بزرگترین انجمنهای علمی چند فرهنگی است و ناشر نشریه مشهور علمی ساینس است. این انجمن مأموریت خود را برای پیشرفت علم و خدمت به جامعه از طریق نوآوریهایی در سیاست علمی، آموزشوپرورش، پشتیبانی حرفهای، مشارکت عمومی با علم انجام میدهد. انجمن پیشرفت علم آمریکا یک منبع پیشرو برای دادهها و آنالیز بهموقع از روند در بودجه علم، تحقیق و توسعه ایالاتمتحده است. هر ساله، درخواست بودجه دولت را آنالیز میکند، مناظرات و صورتحسابهای کنگره در خصوص پشتیبانی از حقوحقوق علم را نظارت میکند و مراقب روند بلندمدت بودجه تحقیق و توسعه در ایالاتمتحده است تا اطلاعات منظم و بهموقع برای سیاستگذاران و جامعه علمی فراهم کند. این انجمن از حقوحقوق علم دفاع مینماید و طبق ماده 15 کنوانسیون بینالمللی حقوق اقتصادی، اجتماعی و فرهنگی، از دولتها خواهان شناختن حقوق برای به دست آوردن مزایای پیشرفت علمی و کاربردهای علم؛ حفظ، توسعه و گسترش علم؛ محترم شمردن آزادی حتمی برای تحقیقات علمی؛ شناخت مزایای ارتباطات بینالمللی و همکاری در زمینه علمی میباشد.https://www.sciencecultivation.ir/article_242718_9edfbb21c38646e8b121e2ffaee219b2.pdfبنیاد پیشبرد علم و فن آوری ایراننشاء علم2008-935X09120181222The Iranian Biological Scientific Associations at a Glanceنگاه اجمالی به انجمنهای علمی علوم زیستی ایران3847242719FAآزادهحکمتواحد علوم و تحقیقات تهران، دانشگاه آزاد اسلامی،علوم پایه،گروه زیستشناسیJournal Article20181128Scientific associations are the main elements of the scientific institutions throughout the world that accelerate progress and development in the production and promotion of science. Considering the importance of the field of biology at the beginning of the third millennium, the biological associations in Iran have been established and are working to provide an appropriate basis for establishing communication between researchers in this field. This article introduces fourteen biological associations in Iran including: Biosafety Society of Iran, Iranian Bioinformatics Society, Biochemical Society of Iran, Iran Society of Biophysical Chemistry, Iranian Biotechnology Society, Iranian Society of Probiotics and Functional Foods, Iranian Proteomics Society, Iranian Society of Biology, Iranian Genetics Society, Crop Science Society of Iran, Iranian Physiology and Pharmacology Society, Iranian Society of Plant Physiology, Iranian Association for Plant Cell and Tissue Culture, and Federation of Iran Bio-Societies and explain their scientific activities in recent decades. Supporting the publication of books, organizing the meetings and scientific workshops, organizing national and international conferences, being the members of national and international organizations, are some of the main activities of the Iranian associations of biological sciences. Publication of 2 scientific journals in English language and about 13 scientific journals in Persian language are the other important activities of the Iranian associations of biological sciences. Although in some of the associations the growth trend has been ups and downs the activities of these associations have been rising over the last decade. Considering the importance and necessity of coordination and cooperation between biological scientific associations, the Federation of Iran Biosocieties has been established with the aim of increasing further cooperation. The regular academics meetings between scientists and industrial elites, creativity and rationality are the solutions to solve biological problems, and can develop science and technology.انجمنهای علمی از عناصر اصلی و زیر بنایی نهادهای علمی در سراسر دنیا هستند که موجب تسریع پیشرفت و توسعه در تولید و ترویج علم میشوند. با توجه به اهمیت حوزه زیستشناسی در آغاز هزاره سوم، انجمنهای حوزه علوم زیستی در ایران با فراهم کردن بستر مناسب برای ایجاد ارتباط میان پژوهشگران این حوزه تأسیسشده و مشغول به فعالیت هستند. در این مقاله به معرفی چهارده انجمن علمی علوم زیستی در ایران شامل: انجمنهای ایمنی زیستی ایران، بیوانفورماتیک ایران، بیوشیمی ایران، بیوشیمیفیزیک ایران، بیوتکنولوژی ایران، پروبیوتیک و غذاهای فراسودمند، پروتئومیکس ایران، زیستشناسی ایران، ژنتیک ایران، علوم و زراعت و اصلاح نباتات ایران، فیزیولوژی و فارماکولوژی ایران، فیزیولوژی گیاهی ایران، کشت سلول و بافت گیاهی ایران و اتحادیه انجمنهای علمی علوم زیستی ایران پرداخته شده و عملکرد آنها در دهه اخیر بررسی شده است. حمایت از چاپ کتاب، برگزاری نشستها و کارگاههای تخصصی، برگزاری همایشهای ملی و بینالمللی، عضویت در مجامع ملی و بینالمللی برخی از فعالیتهای مهم انجمنهای علوم زیستی ایران میباشد. همچنین انتشار دو نشریه به زبان انگلیسی و حدود 13 مجله با درجه علمی-پژوهشی به زبان فارسی از دیگر فعالیتهای حائز اهمیت انجمنهای علوم زیستی میباشد. اگرچه در برخی از انجمنها روند رشد فعالیت دارای فراز و نشیب بوده است اما فعالیت این انجمنها در طی دهه اخیر روند صعودی داشته است و اغلب آنها با فعالیتهای علمی خود سهم بزرگی در ارتقای علوم زیستی در ایران داشتهاند. با توجه به اهمیت و ضرورت هماهنگی و همکاری بین انجمنهای علمی مرتبط با علوم زیستی، اتحادیه انجمنهای علوم زیستی ایران با هدف افزایش زمینه همکاری بیشتر تأسیس گردیده است. گردهمایی و حضور منظم و مستمر فرهیختگان و نخبگان دانشگاهی و صنعتی در کنار یکدیگر، تفکر خلاق و سازنده تنها راهحل یافتنی مسائل و مشکلات حوزه علوم زیستی بوده و میتواند در جهت هرچه بهتر و بیشتر شدن توسعه و پیشرفت علم و فناوری ملی راهگشا باشد.https://www.sciencecultivation.ir/article_242719_46c076656e27395b817aa121af8a4546.pdfبنیاد پیشبرد علم و فن آوری ایراننشاء علم2008-935X09120181222Foodomics: A New Approach to The Influence of Nutrition on The Health of Biological Systemsفودومیک: نگرشی جدید در تأثیر تغذیه بر سلامتی سیستمهای زیستی4852242720FAعلیمسعودی نژادآزمایشگاه سیستم بیولوژی و بیوانفورماتیک(LBB)، مرکز تحقیقات بیوشیمی و بیوفیزیک، دانشگاه تهرانفائزهمتقی طلبآزمایشگاه سیستم بیولوژی و بیوانفورماتیک(LBB)، مرکز تحقیقات بیوشیمی و بیوفیزیک، دانشگاه تهرانعلی اکبرموسوی موحدیمرکز تحقیقات بیوشیمی و بیوفیزیک، دانشگاه تهران، تهران، ایران0000-0002-1707-8432Journal Article20181128Industrialization and developing technologies caused many changes in human being’s life style. Among different aspects of these changes, food and nutrition have the most effects on people’s life. In recent years, studying the effect of food on human’s health and well-being leads to emerging new field of study named "foodomics". The definition of Foodomics as a simple example is: the expression of the gene expression, expression of the protein, and expression of the metabolites in a biological system in a controlled state and treated by different foodstuffs. Then, by comparing the two states, biological markers can be used as indicators affected by food extraction and then construct a model of food effect on the system. In foodomics the aim is to study the impact of different foods and nutrition on biological systems. Researchers in this area use high-throughput technologies like genomics, transcriptomics and metabolomics to define biological systems components threated by foods and then determine the influence of those foods on systems. In this article the purpose is to review why foodomics has been emerged and in continue some bioinformatics and systems biology methods that have application in foodomics have been explained.پیشرفت فناوری و صنعتی شدن منجر به تغییر سبک زندگی بشر شده است، در این بین نوع تغذیه بهعنوان یکی از مؤثرترین عوامل بر کیفیت زندگی افراد از اهمیت ویژهای برخورد میباشد. بررسی تأثیر تغذیه بر سلامتی بشر در سالهای اخیر منجر به بروز قلمرو جدید علمی با عنوان «فودومیک» شده است. فودومیک را میتوان در یک مثال ساده اینطور تعریف نمود: مقادیر بیان ژن، بیان پروتئین و بیان متابولیتهای موجود در یک سامانه زیستی در حالت کنترل و تیمار شده توسط مواد غذایی مختلف اندازهگیری شود، سپس با مقایسه دو حالت بتوان نشانگرهای زیستی را بهعنوان شاخصهای متأثر از تیمار توسط مواد غذایی استخراج کرد و مدلی از تأثیر مواد غذایی بر سیستم ارائه داد. هدف در فودومیک، مطالعه تأثیر مواد غذایی بر سیستم و سامانههای زیستی مختلف میباشد. محققان برای پیشبرد فودومیک به مطالعات انواع فناوریهای توان بالا از جمله ژنومیکس، پروتئومیکس و متابولومیکس میپردازند تا بتوانند اجزای سیستمهای زیستی را بهدرستی تبیین کرده سپس تأثیرات مواد غذایی بر آنها و تهدیدات مورد نظر را ارزیابی کنند. در این مقاله، مروری بر پیدایش رشته فودومیک نگارش شده است و بهاختصار در مورد روشهای مختلف بیوانفورماتیک و سامانه زیستی در قلمرو فودومیک توضیح داده میشود.https://www.sciencecultivation.ir/article_242720_a0e3174d1ccb07a8ceb711770440213a.pdf